1、改良土壤

(1)通過有益菌的大量繁殖，大量有益菌在植物的根系周圍形成了優勢種群，抑制了其他有害菌的生命活動。

(2)快速分解土壤有機物質，促進土壤團粒的形成，且通過有益菌的活動能夠疏松土壤，土壤的保肥、供肥、保水、供水及透氣性都得到很好的調節。

(3)分解土壤中的農藥殘留，避免殘留農藥對下季作物產生藥害。還對植物生長過程通過根系排放的有害物質進行分解。

2、固氮、解磷、解鉀功能

能夠部分利用空氣中的氮，通過有益菌生長代謝產生相應的酶和酸，可對土壤中難溶性的磷、鉀肥(土壤中難溶性磷肥占95%，難溶性鉀占98%)進行分解，從而成為植物所能吸收的磷鉀肥。因此能夠大大提高作物對肥料的利用率，從而減少肥料的施用。

3、提高作物品質。

解磷、解鉀的同時，能夠促使土壤中微量元素的釋放，被作物所利用，同時有益菌代謝產生多種植物所需的物質，如小分子氨基酸、生長刺激物質、維生素等。

4、達到生物防治病害的效果，灌根可抑制土壤中的病菌，噴到葉面，可防止病害的入侵。

5、促進作物早熟和延長采收期。由于土壤理化性質得到改善，土壤養分豐富且平衡，土壤中肥料能夠更好的被作物很好的吸收，因此能夠促進作物早熟和延長采收期。

6、和有機肥配合使用，能夠持續不斷的改良土壤，2-3年就可使土壤完全達到生產有機作物的標準，且因為有益菌能夠快速分解有機物質為作物吸收，所以克服了有機肥料肥效慢的特點，單施有機肥產量低的特點。

7、生物菌肥不像化肥那樣，一次性將過量的可溶性營養元素帶入土壤，生物菌肥可避免環境污染，且有益菌不斷的在植物根系周圍不斷的繁殖代謝，持續地、非過量的向作物提供營養。